Serangan itu juga mendorong Sute untuk mengajak suku Navi lainnya menyerang manusia. Grace berusaha untuk menahan mereka karena ia tahu Kolonel Miles tidak akan tinggal diam. Jack dan Neytiri yang telah kembali juga mendapatkan amukan dari Kolonel Miles. Jack marah karena Jack telah menikahi Neytiri , sehingga pertarungan pun terjadi di antara mereka.
Pada saat yang sama, Kolonel Miles dan pasukannya tiba di kamp penelitian. Ia kemudian menonaktifkan kapsul milik Grace dan Jack, sehingga mereka akhirnya tersadar.
Pada malam harinya, Sute mengajak pasukannya untuk menyerang pusat penambangan. Hal ini semakin memicu emosi Kolonel Miles, dan ia bertekad untuk membunuh mereka semua.
Grace kemudian mengunjungi pusat penambangan dan meminta Parker untuk menghentikan semua ini. Grace berargumen bahwa menghancurkan Pohon Suci dapat merusak jaringan saraf biologis di Pandora. Meskipun begitu, Parker dan Kolonel Miles tetap tidak peduli. Mereka memberikan Grace dan Jack waktu satu jam untuk meyakinkan suku Navi agar dievakuasi sebelum penyerangan dimulai.
Grace dan Jack kemudian berusaha memperingatkan suku Navi, tetapi mereka dianggap sebagai penghianat dan akhirnya ditahan. Setelah satu jam berlalu, Kolonel Miles dan pasukannya tiba, mereka membuhuh Seorang pemimpin suku dan membakar Pohon Suci .Menyadari hal itu moat pun langsung membebaskan Jack dan Grace. dan diminta untuk membantu suku Navi.
Akibat penyerangan tersebut, suku Navi akhirnya gagal mempertahankan pohon raksasa yang selama ini menjadi tempat tinggal mereka.
Semua penduduk pun menangis melihat apa yang telah terjadi. Mereka semua terpaksa harus meninggalkan tempat itu dan mencari rumah baru. Di sisi lain, Jack, Grace, dan Norm terlepas dari avatar mereka dan ditahan.
Untungnya, Rudi datang dan membebaskan mereka. Ia membawa mereka melarikan diri dari kamp. Sayangnya, saat mereka akan melarikan diri, Kolonel Miles menembaki mereka, dan tembakan itu akhirnya melukai Grace.
Untuk mendapatkan kembali kepercayaan bangsa Navi, Jack berusaha menghubungkan pikirannya dengan pikiran toruk. Setelah berhasil, ia pergi ke tempat pengungsian suku Navi dengan mengendalikan toruk. Hal itu membuat para Navi terkejut dan menghormati Jack. Jack pun meyakinkan Sute, yang sekarang menjadi pemimpin suku Navi, bahwa ia akan membantu mereka melindungi para penduduk.
Setelah itu, Jack memohon kepada Moat untuk menyembuhkan Grace. Moat mencoba mentransfer jiwa Grace ke dalam avatarnya dengan bantuan pohon suci. Namun, sayangnya, Grace meninggal dunia sebelum prosesnya selesai.